Critical Health DNA-Sequenzierung

Es wurden kurze RNA-Sequenzen identifiziert, die Mikroproteine ​​und Peptide codieren, was neue Möglichkeiten in der Krankheitsforschung und Arzneimittelentwicklung schafft.

Forscher der Duke-NUS Medical School haben Tausende von DNA-Sequenzen im menschlichen Genom entdeckt, die Mikroproteine ​​und Peptide kodieren, die eine wichtige Rolle bei der menschlichen Gesundheit und Krankheit spielen könnten.

„Vieles von dem, was wir über die 2 % des proteinkodierenden Genoms wissen, stammt von der Suche nach langen Sequenzen von proteinkodierenden Nukleotidsequenzen oder langen offenen Leserahmen“, erklärte Sonia Chothani, Bioinformatikerin und Forscherin im Programm für kardiovaskuläre Erkrankungen . . und Metabolic Metabolic (CVMD) von Duke-NUS und Hauptautor der neuen Studie.

„Wissenschaftler haben jedoch kürzlich kleine offene Leserahmen (smORFs) entdeckt, die auch von RNA in kleine Peptide übersetzt werden können, die eine Rolle bei der DNA-Reparatur, Muskelbildung und Genregulation spielen.“ Sci Tech Daily.

Die Forscher wollten die smORFs und die kleinen Peptide, die sie codieren, identifizieren, da die Inaktivierung von smORFs Krankheiten verursachen kann. Allerdings sind die derzeit verfügbaren Technologien sehr begrenzt.

„Viele aktuelle Datensätze liefern keine ausreichend detaillierten Informationen, um smORFs in RNA zu identifizieren“, warnte Chothani.

Die meisten von ihnen stammen auch aus Analysen unsterblicher menschlicher Zellen, die – manchmal seit Jahrzehnten – veröffentlicht werden, um Zellphysiologie, -funktion und -krankheiten zu untersuchen. Diese Zelllinien sind jedoch nicht immer genaue Darstellungen der menschlichen Physiologie.

Chothani und Forscher aus Singapur, Deutschland, dem Vereinigten Königreich und Australien stellen in einer neuen Studie ihren Ansatz zur Bewältigung dieser Herausforderungen vor. veröffentlicht molekulare Zelle.

Sie analysierten aktuelle Ribosomen-Profiling-Datensätze für kurze RNA-Stränge mit periodischen 3-Basen-Abschnitten, die mehr als 60 % der RNA-Länge abdecken. Anschließend führten sie ihre eigene Sequenzierung und Ribosomencharakterisierung durch, um einen gepoolten Datensatz zu generieren Sechs Arten von Zellen und fünf Arten von Geweben, Hunderte von Patienten.

Analysen identifizierten ungefähr 8000 smORFs. Interessanterweise waren sie sehr spezifisch für das Gewebe, in dem sie gefunden wurden, was bedeutet, dass diese winzigen Zellen möglicherweise eine für ihre Umgebung spezifische Rolle spielen. Das Team identifizierte außerdem 603 Mikroproteine, die von einigen dieser kleinen Proteine ​​kodiert werden.

„Das Genom ist voll von smORFsOwen Rackham, Autor der Studie. „Unsere umfassende Karte sehr kleiner menschlicher Merkmale hebt übersehene funktionelle Komponenten des Genoms hervor, identifiziert neue Akteure bei Gesundheit und Krankheit und stellt der wissenschaftlichen Gemeinschaft eine Ressource als Plattform zur Beschleunigung der Entdeckung zur Verfügung.“

Patrick Casey, ein Forscher bei Duke-NUS, fügte hinzu: „Da sich das Gesundheitssystem weiterentwickelt, um Krankheiten nicht nur zu behandeln, sondern auch zu verhindern, können potenzielle neue Ziele für die Krankheitsforschung und Arzneimittelentwicklung identifiziert werden Wege zu neuen Lösungen eröffnen„.

„Diese Untersuchung von Dr. Chothani und seinem Team, die als Ressource für die wissenschaftliche Gemeinschaft veröffentlicht wurde, schließt mit wichtigen Erkenntnissen auf diesem Gebiet.“